В заказнике сохраняется живописный ландшафт среднего течения реки Луга. В заказник входит излучина р. Луга с устьем рек Оредеж и Переволока и примыкающие к ним территории с холмистым камовым рельефом. Между холмами расположены небольшие озёра и болота.
Растительность на большей части территории представлена сосновыми лесами. По опушкам и склонам холмов в сосняках произрастает комплекс южно-боровых растений, среди них есть очень декоративные, а некоторые виды относятся к охраняемым. Леса с таким комплексом видов за их красоту иногда называют «борами-цветниками» Сосновые леса в заказнике большей частью молодые, возникшие на месте вырубок или пожаров, но есть и участки со старыми соснами возрастом более 150 лет. Ельники занимают небольшие площади и произрастают на надпойменной террасе у р. Луга и в долинах ручьёв. По склонам к рекам Луга и Оредеж и у озёр распространены широколиственные леса с участием дуба, липы, вяза и лещины (орешника), заслуживающие специальной охраны, как и «боры-цветники». В ложбинах между холмами, по берегам ручьёв и озёр встречаются берёзово-черноольховые леса и небольшие осоково-сфагновые болота.
Фауна заказника отличается большим числом видов южного происхождения. Среди птиц отмечены белый аист, перепел, серая куропатка, удод, сизоворонка, а из млекопитающих – заяц-русак, кабан, косуля, 4 вида летучих мышей.
Камовые холмы (характерные формы ледникового и водно-ледникового рельефа в среднем течении р. Луга); сосновые леса с редкими южноборовыми видами сосудистых растений; склоны коренных берегов р. Луга и овраги, покрытые лесами с участием широколиственных пород, включающими участки вязовых, липовых и дубовых лесов; среднее течение р. Луга (часть миграционного пути ценных промысловых видов рыб – лосося и кумжи); поймы рек Луга, Оредеж и Переволока, озёра-старицы, сырые пойменные луга с богатым комплексом водных и околоводных птиц и местами зимовки позвоночных животных; типы почв, занесённые в Красную книгу почв Ленинградской области.
В Красную книгу Российской Федерации или Красную книгу Ленинградской области занесён 31 вид сосудистых растений, отмечавшихся в заказнике: хвощ пёстрый (Equisetum variegatum), полынь эландская (Artemisia oelandica), гвоздика песчаная (Dianthus arenarius), пустынницы мелкожелезистая и скальная (Eremogone micradenia и E. saxatilis), гипсолюбка пучковатая (Gypsophila fastigiata), смолёвка зеленоцветковая (Silene chlorantha), молодило побегоносное (Jovibarba globifera), эспарцет песчаный (Onobrychis arenaria), прострелы луговой и раскрытый (Pulsatilla pratensis и P. patens), мытник скипетровидный (Pedicularis sceptrum-carolinum), турча болотная (Hottonia palustris) и др., а также несколько видов мохообразных и грибов.
В Красную книгу Ленинградской области занесены 5 видов птиц: чёрный коршун (Milvus nigrans), серая куропатка (Perdix perdix), ястребиная славка (Sylvia nisoria), зелёный дятел (Picus viridis), сизоворонка (Coracias garrulus), 2 вида млекопитающих: ночницы усатая и прудовая (Myotis mystacinus и M. dasycneme), а также около 30 видов насекомых.
Для обустройства экологических троп и рекреационных стоянок требуется согласование комитета по природным ресурсам Ленинградской области.
Подробно режим особой охраны изложен в Положении о заказнике «Шалово-Перечицкий» (утверждено постановлением Правительства Ленинградской области от 15.10.2001 № 97).
Любительское и спортивное рыболовство осуществляются в соответствии с Правилами рыболовства для Западного рыбохозяйственного бассейна (утверждены приказом Росрыболовства от 10.12.2008 № 393).
Нарушители режима особой охраны заказника привлекаются к административной ответственности.