В заказнике сохраняется живописный ландшафт среднего течения реки Луга. В заказник входит излучина р. Луга с устьем рек Оредеж и Переволока и примыкающие к ним территории с холмистым камовым рельефом. Между холмами расположены небольшие озёра и болота.
Растительность на большей части территории представлена сосновыми лесами. По опушкам и склонам холмов в сосняках произрастает комплекс южно-боровых растений, среди них есть очень декоративные, а некоторые виды относятся к охраняемым. Леса с таким комплексом видов за их красоту иногда называют «борами-цветниками» Сосновые леса в заказнике большей частью молодые, возникшие на месте вырубок или пожаров, но есть и участки со старыми соснами возрастом более 150 лет. Ельники занимают небольшие площади и произрастают на надпойменной террасе у р. Луга и в долинах ручьёв. По склонам к рекам Луга и Оредеж и у озёр распространены широколиственные леса с участием дуба, липы, вяза и лещины (орешника), заслуживающие специальной охраны, как и «боры-цветники». В ложбинах между холмами, по берегам ручьёв и озёр встречаются берёзово-черноольховые леса и небольшие осоково-сфагновые болота.
Фауна заказника отличается большим числом видов южного происхождения. Среди птиц отмечены белый аист, перепел, серая куропатка, удод, сизоворонка, а из млекопитающих – заяц-русак, кабан, косуля, 4 вида летучих мышей.
Камовые холмы (характерные формы ледникового и водно-ледникового рельефа в среднем течении р. Луга); сосновые леса с редкими южноборовыми видами сосудистых растений; склоны коренных берегов р. Луга и овраги, покрытые лесами с участием широколиственных пород, включающими участки вязовых, липовых и дубовых лесов; среднее течение р. Луга (часть миграционного пути ценного промыслового вида рыб – лосося и кумжи); поймы рек Луга, Оредеж и Переволока, озёра-старицы, сырые пойменные луга с богатым комплексом водных и околоводных птиц и местами зимовки позвоночных животных; типы почв, занесённые в Красную книгу почв Ленинградской области.
В Красную книгу Российской Федерации занесён прострел луговой (Pulsatilla pratensis). В Красную книгу Ленинградской области занесены ещё 12 видов сосудистых растений – хвощ пёстрый (Equisetum variegatum), полынь эландская (Artemisia oelandica), гвоздика песчаная (Dianthus arenarius), пустынница мелкожелезистая (Eremogone micradenia), пустынница высокая (E. procera), гипсолюбка пучковатая (Gypsophila fastigiata), смолёвка зеленоцветковая (Silene chlorantha), молодило побегоносный (Jovibarba globifera), эспарцет песчаный (Onobrychis arenaria), прострел раскрытый (Pulsatilla patens), мытник скипетровидный (Pedicularis sceptrum-carolinum), турча болотная (Hottonia palustris); 4 вида грибов – пикнопореллюс блестящий (Pycnoporellus fulgens), цистодерма Амброзиуса (Cystoderma ambrosii), гиропор синеющий (Gyroporus cyanescens), плютей умбровый (Pluteus umbrosus).
В Красную книгу Ленинградской области занесены 6 видов птиц: чёрный коршун (Milvus nigrans), серая куропатка (Perdix perdix), перепел (Coturnix coturnix), ястребиная славка (Sylvia nisoria), зелёный дятел (Picus viridis), сизоворонка (Coracias garrulus), 5 видов млекопитающих – рыжая вечерница (Nyctalis noctula), водяная (Myotis daubentoni), усатая (M. mystacinus) и прудовая (M. dasycneme) ночницы и европейская косуля (Capreolus capreolus), а также 32 вида насекомых.
Для обустройства экологических троп и рекреационных стоянок требуется согласование комитета по природным ресурсам Ленинградской области.
Подробно режим особой охраны изложен в Положении о заказнике «Шалово-Перечицкий» (утверждено постановлением Правительства Ленинградской области от 15.10.2001 № 97).
Любительское и спортивное рыболовство осуществляются в соответствии с Правилами рыболовства для Западного рыбохозяйственного бассейна (утверждены приказом Росрыболовства от 10.12.2008 № 393).
Нарушители режима особой охраны заказника привлекаются к административной ответственности.